161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2461 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
344 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  91.81 
 
 
344 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  91.52 
 
 
344 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  66.67 
 
 
349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  60.7 
 
 
349 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  62.39 
 
 
329 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  57.28 
 
 
340 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  42.46 
 
 
352 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  44.74 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 
371 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  41.02 
 
 
349 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  41.52 
 
 
365 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 
365 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  42.09 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  40.87 
 
 
400 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  40.96 
 
 
357 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  35.98 
 
 
343 aa  232  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  35.09 
 
 
348 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  43.23 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  39.31 
 
 
359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  37.35 
 
 
341 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
359 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  38.83 
 
 
359 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.83 
 
 
359 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  38.83 
 
 
359 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  38.83 
 
 
359 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  38.83 
 
 
383 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  38.83 
 
 
359 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  37.46 
 
 
359 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 
361 aa  205  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  37.75 
 
 
359 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  37.39 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  37.46 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  37.1 
 
 
359 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  35.82 
 
 
369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 
358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  36.9 
 
 
359 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
359 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  36.73 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  36.62 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  36.31 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  36.34 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  39.57 
 
 
331 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  35.49 
 
 
359 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 
354 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  33.43 
 
 
354 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  37.32 
 
 
362 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  34.38 
 
 
354 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  39.82 
 
 
374 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  34.87 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  36.81 
 
 
357 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  37.76 
 
 
326 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.52 
 
 
357 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  34.18 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  32.98 
 
 
394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  36.63 
 
 
363 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 
356 aa  178  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  34.5 
 
 
354 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 
321 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
321 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  31.1 
 
 
353 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
324 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
324 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  32.31 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 
324 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
329 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  28.61 
 
 
355 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 
314 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  30.28 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.85 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  22.05 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30.53 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  23.48 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  25.15 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.18 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  21.56 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>