More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1991 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
310 aa  613  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  47.85 
 
 
308 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  47.39 
 
 
312 aa  265  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  46.67 
 
 
308 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  44.16 
 
 
322 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  40.13 
 
 
331 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  40.2 
 
 
337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  40.32 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  39.37 
 
 
330 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  38.84 
 
 
318 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 
308 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  41.78 
 
 
318 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 
308 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 
321 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  36.01 
 
 
361 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  32.89 
 
 
323 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  34.96 
 
 
326 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  35.37 
 
 
323 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  35.37 
 
 
323 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  35.37 
 
 
326 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 
301 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  39.04 
 
 
306 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  34.55 
 
 
323 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 
328 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  34.96 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  34.96 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  41.6 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  34 
 
 
318 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 
307 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  34.54 
 
 
310 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  34.47 
 
 
316 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  36.89 
 
 
302 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  36.64 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.31 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  38.85 
 
 
305 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.21 
 
 
312 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  33.11 
 
 
327 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  39.9 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  34.75 
 
 
296 aa  144  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 
307 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  39.33 
 
 
297 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
325 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  35.37 
 
 
333 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  34.96 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  40.17 
 
 
306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 
305 aa  135  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  36.48 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  34.92 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 
267 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  35.81 
 
 
307 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  34.14 
 
 
264 aa  126  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 
306 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  36.91 
 
 
318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 
297 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  37.18 
 
 
318 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 
266 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 
259 aa  96.3  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 
234 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
226 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
244 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.65 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  34.87 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  29.68 
 
 
210 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 
231 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 
208 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  29.1 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  25.48 
 
 
293 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  21.24 
 
 
213 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 
217 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 
209 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 
207 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.12 
 
 
348 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  27.31 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
231 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  25.45 
 
 
238 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
211 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0538  Beta-lactamase-like  41.18 
 
 
233 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  34.46 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  26.56 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  29.63 
 
 
213 aa  57  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>