201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2754 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05310  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  41.42 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.39 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0460  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516875  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  31.08 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4498  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 		 194 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4497  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 208 aa  85.1  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000128242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1310  beta-lactamase domain protein  23.44 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  23.72 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  25.14 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  26.07 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  27.92 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  26.16 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  26.07 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 321 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  25.59 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  25.59 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  25.59 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  24.22 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  25.59 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  25 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  25.57 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0787298 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.91 
 
 		 316 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  28.65 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 294 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  26.48 
 
 		 309 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  24.09 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  25 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  22.91 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  21.5 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  30.49 
 
 		 399 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  30.49 
 
 		 399 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  28.41 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.18 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  27.7 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 384 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 		 325 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  23.59 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  30.68 
 
 		 290 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  24.4 
 
 		 309 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  23.96 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  32.5 
 
 		 294 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  23.97 
 
 		 321 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  27.66 
 
 		 278 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  25.45 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  21.51 
 
 		 346 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  23.08 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.88 
 
 		 352 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  25.78 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0194  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 528 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.45 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  25.56 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  34.15 
 
 		 878 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  34.15 
 
 		 878 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  23.4 
 
 		 333 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 332 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 		 306 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 348 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>