More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1287 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  45.95 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  45.83 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  33.92 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  33.18 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  26.39 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  31.76 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  29.22 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  34.59 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  29.68 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  29.54 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  29.13 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  30.62 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  32.35 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4498  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  27.4 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  25.5 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.73 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.65 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  38.96 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2193  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  27.5 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4497  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000128242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1310  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  27.36 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  34.29 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  32.91 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  28.84 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  26.62 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  40.79 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  28.37 
 
 		 285 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2191  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  27.91 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1679  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  27.91 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  30 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  28.38 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  29.55 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.53 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  27.44 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>