257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0546 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 297 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  51.85 
 
 		 317 aa  265  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0123  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235522  normal  0.0165193 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  31.99 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  26.62 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  27.71 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  27.66 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  28.9 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  26.41 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  25.97 
 
 		 217 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  25.54 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  25.54 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  25.54 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  25.54 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  25.54 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  23.55 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  28.36 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  23.21 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.49 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  25.74 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  24.64 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  26.7 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  26.72 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  29.59 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  22.83 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 244 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.31 
 
 		 212 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  29.74 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  28.04 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  28.86 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 		 320 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  29.67 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 361 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  28.46 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 226 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 214 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  28.29 
 
 		 288 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  25.48 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 		 350 aa  52.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.63 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  24.64 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  22.84 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  28.46 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  30.43 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  25 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  23.91 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  23.65 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>