More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0513 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  460  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  62.45 
 
 
228 aa  293  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 
273 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.9 
 
 
329 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  27.32 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.32 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  27.18 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  27.18 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  27.18 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  27.18 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  26.34 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
256 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  27.18 
 
 
217 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 
246 aa  61.6  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  26.5 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  27.49 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  26.29 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  29.01 
 
 
191 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  32.61 
 
 
331 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.3 
 
 
346 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  26.29 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  28.12 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
294 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 
329 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  26.02 
 
 
228 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  28.26 
 
 
295 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
305 aa  58.5  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.56 
 
 
278 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  28.07 
 
 
331 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
324 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3406  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 
342 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.317826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 
322 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
339 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  26.92 
 
 
272 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  25 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  26.02 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 
259 aa  56.6  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  25.85 
 
 
277 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 
361 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  28.89 
 
 
260 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  26.76 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
213 aa  55.5  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 
337 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  24.22 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  28.87 
 
 
297 aa  55.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
321 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
310 aa  53.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  23.65 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  24.55 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  24.79 
 
 
285 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  24.55 
 
 
281 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.63 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
247 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  32.03 
 
 
307 aa  52.4  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 
213 aa  52  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
235 aa  51.6  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 
315 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  23.98 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  25.45 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 
323 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  25.62 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>