260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3009 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  599  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  76.74 
 
 		 301 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  37.99 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  38.33 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  31.19 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0164  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  34.51 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 		 269 aa  92.4  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  33.16 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.26 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.03 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.98 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.87 
 
 		 252 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.98 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  26.05 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.11 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  28.88 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  27.27 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  44.93 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 		 198 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  27.97 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.12 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 214 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  23.58 
 
 		 272 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  30.57 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 		 206 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 425 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0559  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.48 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.199984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.34 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000239023  normal  0.0635677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  30.08 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 218 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.01 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  31.68 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0806  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.9 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0137889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  26.96 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.9 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.34 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000229771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1287  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.9 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000101374  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06151  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  23.68 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.117028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  23.81 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  28.9 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4732  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.47 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.32 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.03 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.9 
 
 		 268 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  29.3 
 
 		 232 aa  50.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 213 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  26.83 
 
 		 201 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.68 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2260  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  23.5 
 
 		 196 aa  49.7  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1889  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.88 
 
 		 264 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.68 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 		 204 aa  49.3  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  29.31 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  29.48 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  20.62 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  28.93 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.48 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.98 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  28.14 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05851  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  25.76 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.597895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06141  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  32.88 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  29.34 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  29.34 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1258  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  44.64 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  25.39 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  32.62 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>