More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2769 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 295 aa  607  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  46.79 
 
 		 291 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  47.74 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  37.46 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  27.12 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 243 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  34.42 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  34.93 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.39 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  33.53 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  26.62 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  35.62 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  30.2 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.17 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  28.06 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  32.92 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  32.12 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.87 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  34.64 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  33.13 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  32.9 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.29 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.72 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  32.69 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  32.9 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  32.87 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  32.69 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  32.9 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  26.87 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  32.9 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 226 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 		 263 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.9 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  32.26 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  33.57 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.06 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  27.98 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  29.79 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  28.25 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1736  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  29.89 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  30.72 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  25.81 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  29.51 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.54 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  30.32 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  26.56 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  31.37 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  29.08 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  26.29 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  27.89 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.32 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  29.46 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.32 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.32 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  32.52 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.32 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.32 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>