More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0528 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 317 aa  615  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  51.85 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  42.95 
 
 		 341 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0123  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235522  normal  0.0165193 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.12 
 
 		 295 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  31.34 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  31.65 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  24.15 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  25.97 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  26.2 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 		 230 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  23.77 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  25.94 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  25.32 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  27.87 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  28.7 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  24.89 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  24.89 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  24.89 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  24.89 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  27.87 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  25.75 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 214 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 355 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  31.1 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.53 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  26.34 
 
 		 213 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  22.54 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  29.86 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  25 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  29.2 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  23 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  23 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  23 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  22.95 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  23.65 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  23.14 
 
 		 260 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  24.05 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  30.58 
 
 		 218 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.29 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 262 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 		 330 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  22.27 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  21.62 
 
 		 262 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>