More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1736 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1736  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
198 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1279  beta-lactamase domain protein  50.25 
 
 
199 aa  217  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1251  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 
196 aa  131  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.809975  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0123  beta-lactamase-like  35 
 
 
199 aa  129  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.998731  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0122  beta-lactamase-like  33.67 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151592  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3157  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1442  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  30.32 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.19 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1765  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2544  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0383  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 
545 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1181  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  26.39 
 
 
311 aa  71.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.73 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.73 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.73 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.73 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.73 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.12 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  29.35 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.86 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 
218 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  30.17 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  30.17 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  34.44 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  26.6 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.09 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  32.21 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  28.36 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 
302 aa  65.1  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  30.73 
 
 
295 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1258  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  30.5 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  30.38 
 
 
566 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  40 
 
 
284 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.67 
 
 
242 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  31.61 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
255 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
310 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
278 aa  62.8  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
268 aa  62.4  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  32.26 
 
 
291 aa  62  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  29.08 
 
 
254 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.29 
 
 
259 aa  62  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
310 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  29.07 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 
210 aa  62  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.08 
 
 
257 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.08 
 
 
257 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 
215 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 
214 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.73 
 
 
214 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  26.51 
 
 
217 aa  60.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  26.37 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 
303 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  25.36 
 
 
307 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  32 
 
 
340 aa  59.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.75 
 
 
257 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 
310 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>