More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1279 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1279  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1736  beta-lactamase domain protein  50.25 
 
 		 198 aa  217  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1251  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.809975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0123  beta-lactamase-like  31.31 
 
 		 199 aa  120  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.998731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0122  beta-lactamase-like  30.5 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2544  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3157  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  29.85 
 
 		 566 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1181  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  25.36 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1442  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  28.04 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.57 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1765  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.2 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  35.48 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.31 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  31.21 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  38.06 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  40 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  27.32 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.58 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.53 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  30.06 
 
 		 566 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0383  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  29.15 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  37.14 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.96 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  31.19 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.19 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.08 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  30 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1258  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  30.5 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  31.69 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0926  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.15 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.38 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.02 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  24.43 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.65 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  29.08 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  28.27 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  32.33 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  24.04 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.07 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 355 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  26.42 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.8 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  29.49 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  28.16 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  36.47 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.47 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>