More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0052 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  65.48 
 
 
200 aa  274  7e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  59.38 
 
 
199 aa  224  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  54.4 
 
 
191 aa  202  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  46.94 
 
 
200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  45.24 
 
 
213 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  40.76 
 
 
211 aa  147  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  39.5 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  47.62 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  38.51 
 
 
208 aa  106  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  46.54 
 
 
207 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  41.98 
 
 
213 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  35.91 
 
 
210 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  39.77 
 
 
214 aa  101  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  42.59 
 
 
208 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  37.06 
 
 
201 aa  98.2  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  39.74 
 
 
231 aa  97.1  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  38.07 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  37.95 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  39.52 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  42.28 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  37.87 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.45 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  38.04 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  36.75 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 
211 aa  92  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  34.81 
 
 
213 aa  91.7  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.5 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  41.22 
 
 
216 aa  91.3  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
251 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.59 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  38.22 
 
 
209 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  37.65 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
231 aa  89.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  37.79 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  40.72 
 
 
205 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  43.32 
 
 
217 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  39.22 
 
 
207 aa  89  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  37.21 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.65 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.65 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.65 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.65 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.65 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.67 
 
 
209 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  39.49 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  40.56 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  39.39 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.43 
 
 
216 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  37.87 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  37.42 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  37.04 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  37.2 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  36.08 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  36.81 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  41.45 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  36.05 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.68 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  38.22 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  36.71 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
214 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  38.54 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  36.67 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.61 
 
 
229 aa  79  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  35.26 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  32.99 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>