More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0415 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  65.83 
 
 
200 aa  260  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  59.38 
 
 
200 aa  224  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  55.85 
 
 
191 aa  204  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  45.51 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  41.35 
 
 
213 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  37.5 
 
 
211 aa  124  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 
206 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  33.97 
 
 
214 aa  98.2  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  40.62 
 
 
216 aa  94.4  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  37.06 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 
205 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  37.87 
 
 
251 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  42 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.02 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.37 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  41.38 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  33.92 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.64 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.79 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  31.52 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  36.67 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  32.14 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.76 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  38.12 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  31.52 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  34.46 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.97 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  33.51 
 
 
216 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.67 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.16 
 
 
222 aa  72  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  34.05 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  33.51 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0543  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  38.93 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.54 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  33.56 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.29 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  31.9 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  31.71 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.29 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.29 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.29 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.29 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  31.29 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  33.52 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  31.29 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  33.14 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  32.48 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  31.29 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  31.71 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  29 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  31.29 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  33.88 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  35.37 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  31.29 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  30.89 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.62 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.63 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>