261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1835 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  61.92 
 
 
260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  62.39 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  51.68 
 
 
252 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  45.73 
 
 
260 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0286  metallo-beta-lactamase family protein  44.93 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0623831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3102  hypothetical protein  42.92 
 
 
255 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  41.74 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  39.91 
 
 
241 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3917  beta-lactamase-like  39.65 
 
 
272 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.575849  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 
231 aa  85.5  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
226 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  26.47 
 
 
232 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 
226 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 
318 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  28.33 
 
 
306 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  25.34 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  24.61 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  28.35 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  28.35 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26 
 
 
363 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  25.14 
 
 
331 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 
294 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  31.87 
 
 
217 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 
324 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  27.84 
 
 
326 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 
310 aa  56.2  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  27.84 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
317 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  27.84 
 
 
323 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  26.7 
 
 
323 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
364 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 
228 aa  55.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  27.18 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  27.98 
 
 
364 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  22.99 
 
 
329 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
321 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 
408 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
339 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 
312 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.93 
 
 
278 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  21.62 
 
 
317 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 
215 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  26.56 
 
 
301 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  26.07 
 
 
323 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.11 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  27.85 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  26.13 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2193  beta-lactamase domain protein  22.98 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 
302 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  27.03 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  26.07 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  22.89 
 
 
211 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  25.22 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 
310 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  24.07 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  28.19 
 
 
317 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  24.19 
 
 
228 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  24.19 
 
 
228 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  24.19 
 
 
228 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  28.19 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 
304 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  23.51 
 
 
322 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  25.48 
 
 
228 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  28.19 
 
 
317 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  22.57 
 
 
304 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  28.86 
 
 
317 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  29.13 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  28.19 
 
 
317 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  23.03 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
402 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  28.48 
 
 
208 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  23.56 
 
 
323 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 
444 aa  49.3  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 
288 aa  49.3  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  27.81 
 
 
213 aa  48.9  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.92 
 
 
215 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1594  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
313 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  21.24 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>