75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3917 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3917  beta-lactamase-like  100 
 
 		 272 aa  565  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.575849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0286  metallo-beta-lactamase family protein  55.6 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0623831  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  57.26 
 
 		 241 aa  298  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  56.07 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3102  hypothetical protein  50.41 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  46.56 
 
 		 260 aa  241  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  45.57 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  43.78 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  42.48 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  39.65 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  24.77 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  22.77 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  24.18 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  24.22 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  26.29 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  24.86 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  21.72 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  25.42 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  26.54 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  22.96 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  24.29 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  24.64 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  22.33 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  23.81 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  20.75 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  22.91 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  25.4 
 
 		 363 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  22.02 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.02 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  24.29 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  23.78 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 368 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  20.6 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  23.6 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  24.39 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  23.46 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 		 209 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  21.56 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 		 209 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 		 209 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  26.09 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 310 aa  42.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 348 aa  42.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  24.7 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 192 aa  42  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>