36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0286 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0286  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 251 aa  520  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0623831  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  59.83 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3102  hypothetical protein  56.43 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  57.39 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3917  beta-lactamase-like  55.6 
 
 		 272 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.575849  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  47.9 
 
 		 252 aa  245  6e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  47.39 
 
 		 260 aa  244  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  45.12 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  46.7 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  44.93 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  36.51 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  25.7 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  22.33 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.03 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  25.46 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  26.7 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  24.02 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  28.14 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  25.81 
 
 		 209 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 		 332 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 		 347 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 325 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  22.12 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  21.66 
 
 		 241 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>