170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06736 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  100 
 
 		 249 aa  517  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  84.23 
 
 		 241 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0286  metallo-beta-lactamase family protein  57.39 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0623831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3917  beta-lactamase-like  56.07 
 
 		 272 aa  270  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.575849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3102  hypothetical protein  51.28 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  46.09 
 
 		 252 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  45.45 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  44.95 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  41.74 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  41.74 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.87 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  26.87 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.87 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.87 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  25.24 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  26.43 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  25.99 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  25.14 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  24.38 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  26.83 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  24.39 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  25.14 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  24.39 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  25.16 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  24.36 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  23.9 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  23.79 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 307 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 		 317 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  23.79 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  23.79 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  23.79 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  24.57 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  21.67 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 324 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  25.25 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  23.79 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  23.63 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  25.25 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  21.86 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4043  stage V sporulation protein AE  31.93 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  31.4 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  29.19 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 316 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  24.48 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  22.57 
 
 		 324 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  25 
 
 		 315 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 		 332 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 		 209 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.06 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 347 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 325 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  27.47 
 
 		 348 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  22.96 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  25.47 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  23.77 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  22.05 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  28.74 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  26.63 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>