277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1934 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 347 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  72.62 
 
 		 364 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  72.62 
 
 		 364 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  49.86 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  40.95 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  37.71 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  43.46 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  41.7 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  42.05 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  42.4 
 
 		 315 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  39.09 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  41.64 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  35.21 
 
 		 314 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  34.42 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  31.1 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.27 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.18 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  32.75 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.79 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  30.85 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 307 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  30.63 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  32.03 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.48 
 
 		 438 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 302 aa  96.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 307 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.04 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 342 aa  92.8  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 312 aa  85.9  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  25.67 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.02 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.96 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.96 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  24.75 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  28.68 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  23.91 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  26.35 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  31.63 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  27.38 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  30.51 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  25.74 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  27.14 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  26.67 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  30.93 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  26.72 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  28.03 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.65 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  27.38 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  28.74 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  26.62 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>