248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2056 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 340 aa  704    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 337 aa  99.4  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  30.91 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  24.91 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  27.97 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 318 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25.26 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 364 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 309 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  25.84 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  27.18 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.56 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 312 aa  89.4  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  24.4 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  26.28 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  26.28 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  31.5 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  23.53 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  21.08 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 597 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  26.62 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  24.49 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  24.3 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  22.34 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  23.97 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  24.13 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  23.41 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  23.41 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  23.05 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.85 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.98 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  21.85 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  22.15 
 
 		 644 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  24.22 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  23.41 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  21.2 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  21.32 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  25.12 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  21.32 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  20.14 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  23.18 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  21.12 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  21.48 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  22.75 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  27.59 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  26.85 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  22.6 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  26.72 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  31.58 
 
 		 653 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  28.09 
 
 		 700 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.72 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>