205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1553 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 322 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  55.14 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  49.83 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  46.6 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  47.41 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  44.85 
 
 		 339 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  35.06 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  34.26 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  38.01 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.46 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  34.96 
 
 		 289 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  30.98 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  35.24 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 291 aa  133  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  32.69 
 
 		 288 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  33.07 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.56 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.62 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  28.34 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  30.46 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  28.96 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  25.7 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  25.45 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  31.16 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  24.59 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  29.2 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  23.29 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  23.32 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.4 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  22.64 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  23.69 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23.28 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  22.48 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  23.32 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  23.85 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  25.66 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.72 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.11 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  26.32 
 
 		 644 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  27.02 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  24.48 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  22.53 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.86 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  24.51 
 
 		 637 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  28.42 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  23.93 
 
 		 438 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  22.67 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  24.36 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.37 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  25 
 
 		 334 aa  52.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  24.66 
 
 		 327 aa  52.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  27.43 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  22.53 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  21.76 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.91 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  23.31 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  25.61 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  24.86 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>