225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1888 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  55.14 
 
 		 322 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  50.62 
 
 		 319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  50.17 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  49.81 
 
 		 313 aa  279  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  48.16 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  36.4 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  38.68 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  30.57 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  31.1 
 
 		 309 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  35.44 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  29.03 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  28.32 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.06 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.06 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.82 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  26.45 
 
 		 438 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  27.43 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  33.55 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.02 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.4 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  25.7 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  25.93 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  25 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  27.08 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  26.39 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  24.68 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  23.1 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.91 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  24.23 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  24.3 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  22.84 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  26.36 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  22.94 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  23.84 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  24.91 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  23.16 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  24.58 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  23.16 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  23.16 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 210 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  23.51 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  23.21 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  22.81 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  25.38 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  24.14 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  24.14 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.41 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.31 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>