More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0298 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 349 aa  718    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  46.3 
 
 		 314 aa  278  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  49.48 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  48.93 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  44.76 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  47.87 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  46.53 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  44.66 
 
 		 310 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  44.98 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  44.82 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  45 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  42.76 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  41.7 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  39.3 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  41.32 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  40.99 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  40.21 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  30.36 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  33.23 
 
 		 351 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.08 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.92 
 
 		 287 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  36.52 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  36.52 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  29.63 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  29.9 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.02 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.39 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.73 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  29.39 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  30.54 
 
 		 312 aa  99.4  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 		 597 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 		 271 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 		 312 aa  95.9  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 315 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 315 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 343 aa  86.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 		 271 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  30.31 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  26.85 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  26.18 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  25.81 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  31.19 
 
 		 637 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  27.73 
 
 		 644 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  27.06 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.93 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  24.05 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  26.22 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  22.67 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.47 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  23.19 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  26.94 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  23.05 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  21.59 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  24.72 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  24.35 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>