170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2395 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  628  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  45.83 
 
 
319 aa  302  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  45.79 
 
 
321 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  48.71 
 
 
339 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  45.34 
 
 
322 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  43.8 
 
 
318 aa  248  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.72 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  29.94 
 
 
296 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
297 aa  142  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  30.58 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  29.35 
 
 
292 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  28.52 
 
 
289 aa  132  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  30.91 
 
 
288 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 
287 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
291 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.57 
 
 
294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 
313 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 
310 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
299 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.3 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 
297 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 
351 aa  79  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  27.66 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.92 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  27.97 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.15 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.65 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.81 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  23.88 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.52 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  26.55 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 
210 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 
249 aa  63.5  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  25.54 
 
 
349 aa  62.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  24.07 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  27.38 
 
 
637 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  22.53 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  26.97 
 
 
644 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.92 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  29.1 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
315 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  23.64 
 
 
316 aa  56.2  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 
251 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25.99 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  25.59 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  24.82 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  25.28 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
275 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 
290 aa  52.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 
332 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 
275 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 
318 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  25.1 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  27.03 
 
 
207 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  23.91 
 
 
595 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  23.88 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  29.93 
 
 
209 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  23.83 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  20.39 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 
346 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
312 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>