224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3306 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 315 aa  634    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  71.03 
 
 		 315 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.08 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 249 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 272 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.87 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.04 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  28.68 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  31.46 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.63 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  23.33 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  27.37 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  27.78 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  31.31 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  30.34 
 
 		 637 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  31.72 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  30.26 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  29.08 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  29.08 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  25.95 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  30.84 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  21.62 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  30.84 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  28.34 
 
 		 644 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  30.84 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  30.84 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  30.84 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  30.84 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  30.84 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.31 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.36 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  30.62 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.12 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  30.62 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.51 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  31.56 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.5 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.8 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  28.19 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.42 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  28.38 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>