212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 319 aa  642    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  69.18 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  66.67 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  63.52 
 
 		 319 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  62.07 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  61.95 
 
 		 322 aa  378  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  48.9 
 
 		 316 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  47.65 
 
 		 318 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  48.9 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  48.9 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  48.28 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  46.23 
 
 		 318 aa  308  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  49.06 
 
 		 317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  48.14 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  47.96 
 
 		 321 aa  298  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  47.02 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  46.23 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  47.52 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  46.39 
 
 		 316 aa  295  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  47.2 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  47.15 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  49.69 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  49.69 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  46.37 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  47.35 
 
 		 319 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  46.08 
 
 		 319 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  46.73 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  46.37 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  46.37 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  46.37 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  46.37 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  46.37 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  46.37 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  46.37 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  46.25 
 
 		 321 aa  281  9e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  45.96 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  45.34 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  45.03 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  44.72 
 
 		 319 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  44.28 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  46.27 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  46.27 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  44.55 
 
 		 319 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  43.61 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  43.93 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  43.93 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  43.61 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  43.93 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  43.93 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  49.38 
 
 		 264 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  33 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  24.73 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  27.18 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.3 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  32.17 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25.94 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.33 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  32.71 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  26.74 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  26.23 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.18 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  23.59 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  32.54 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  27.64 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  23.92 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.83 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 271 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.19 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  26.14 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1299  beta-lactamase-like protein  51.02 
 
 		 49 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.714571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  23.56 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>