156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0225 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  100 
 
 		 378 aa  790    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  58.38 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  53.97 
 
 		 382 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  37.37 
 
 		 438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  35.09 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 		 319 aa  97.1  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 		 305 aa  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.6 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  25.79 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  25.71 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  28.45 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  23.15 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  27.2 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  25.68 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.21 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  24.22 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  24.5 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  24.61 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  26.78 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  23.75 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  22.68 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  25.11 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  25.11 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  23.92 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.63 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  21.85 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  25.21 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.51 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  23.16 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  22.85 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.21 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.56 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  25.21 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.49 
 
 		 316 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  22.88 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  22.59 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  22.66 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  24.46 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  23.44 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.5 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  23.61 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.61 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  21.84 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  21.84 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  24.83 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  33.33 
 
 		 637 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  23.18 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  25.55 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  23.23 
 
 		 320 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  22.66 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  24.04 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>