252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2858 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 337 aa  695    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  42.91 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  36.39 
 
 		 312 aa  195  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  39.74 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  36.88 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  35.56 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  32.36 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  29.15 
 
 		 367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.22 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  28.52 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.62 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  27.62 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 352 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 346 aa  109  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.4 
 
 		 287 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.27 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  31.7 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  31.37 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  27.67 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  27.05 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  25.78 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  28.47 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  30.67 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 310 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  29.8 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  29.8 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 310 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 321 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.02 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  27.97 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  26.95 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 308 aa  93.6  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  30.21 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  30.38 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.23 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 307 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.46 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  30.21 
 
 		 319 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 326 aa  85.9  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  30.17 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  28 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  28.51 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  28.05 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  22.01 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  23.51 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>