250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5952 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 308 aa  618  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  56.38 
 
 		 315 aa  298  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  51.52 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  53.93 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  48.81 
 
 		 327 aa  271  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  46.88 
 
 		 349 aa  261  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  41.16 
 
 		 314 aa  248  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  46.1 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  47.67 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  43.82 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  44.52 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  43.46 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  43.11 
 
 		 310 aa  225  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  44.67 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  45.15 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  43.82 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  43 
 
 		 351 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  32.62 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 309 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  35.27 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  34.06 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  32.81 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.88 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 299 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  34.73 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 		 438 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  32.39 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  34.14 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  28.92 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.96 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  29.7 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.14 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  31.8 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  29.92 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.74 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  27.07 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  30.22 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 		 597 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  24.92 
 
 		 343 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  30.53 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.76 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  24.52 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  32.05 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.52 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.52 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  29.41 
 
 		 644 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  27.63 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.25 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.36 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  31.77 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  34.69 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  30.09 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  29.41 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>