154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2106 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 315 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  99.68 
 
 		 315 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  54.7 
 
 		 334 aa  328  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  53.66 
 
 		 298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  52.51 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  45.7 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  43.55 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  43.21 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  39.87 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  42.51 
 
 		 342 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  40.41 
 
 		 309 aa  222  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  37.42 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 		 597 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  29.13 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.34 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.93 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.93 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  30.48 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 310 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  29.03 
 
 		 364 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  31.25 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.1 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.91 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.93 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.47 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.33 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  25.87 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  26.23 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  26.7 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  30.58 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  24.14 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  22.93 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  24.56 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.57 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  21.37 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  27.59 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  24.63 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  25.91 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  25.78 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  28.2 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  24.48 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.11 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  22.73 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  19.93 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  23.82 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.5 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  23.25 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.02 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  25.2 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  24.7 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.02 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  21.46 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.3 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 339 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>