221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2531 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 312 aa  638    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  60.26 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  41.99 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 		 438 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  36.3 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  32.91 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  35.21 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  29.24 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  29.35 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.72 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  30.85 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  25.26 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  28.08 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.38 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.08 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  27.14 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.01 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  27.05 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.62 
 
 		 310 aa  95.9  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.77 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  31.1 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.54 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 321 aa  92.4  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  30.74 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  25.77 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.43 
 
 		 312 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  27.03 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 364 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  25.08 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  23.93 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  26.04 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.77 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  24.81 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.97 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  25.6 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  26.8 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25.87 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.23 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  24.23 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.23 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  28.37 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  28.37 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  25.16 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  27.95 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.09 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  23.55 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  26.23 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  26.23 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  24.72 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.22 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>