More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2589 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  719    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  97.53 
 
 		 364 aa  703    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  72.62 
 
 		 347 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  51.56 
 
 		 351 aa  302  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 		 352 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  39.26 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  44.33 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  44.52 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  41.34 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  43.42 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  40.99 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  39.79 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  37.19 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 		 310 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.08 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.5 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  33 
 
 		 318 aa  113  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.77 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  29.08 
 
 		 438 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  32.2 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  27.66 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  31.23 
 
 		 351 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  28.28 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 307 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  32.81 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 343 aa  97.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.47 
 
 		 298 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  25.84 
 
 		 340 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 597 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  30.42 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 319 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  29.81 
 
 		 319 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.2 
 
 		 318 aa  87.4  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  32.83 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  32.83 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.81 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.63 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  25.67 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.92 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  27.86 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  28.47 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  32.72 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  25.52 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  24.67 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  29.5 
 
 		 637 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  26.41 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  26.87 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  25 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  30.39 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  29.27 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.77 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>