254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3399 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  46.27 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  48.84 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  47.13 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  51.39 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  51.74 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  44.76 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 352 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  46.01 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  40.87 
 
 		 320 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  39.88 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  41.03 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  39.79 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  39.01 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  38.7 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  39.09 
 
 		 347 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  42.32 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  37.79 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  36.63 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  36.5 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  32.81 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  33.11 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  32.98 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  36.22 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  35.39 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  32.01 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  31 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  31 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.5 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 342 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  30.85 
 
 		 334 aa  99.4  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 		 271 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  33.47 
 
 		 644 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 271 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  28.68 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.03 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  28.53 
 
 		 330 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  24.4 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  27.37 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 		 597 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  26.28 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.6 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  30.25 
 
 		 637 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  32.08 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.48 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.2 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.67 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.4 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.4 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  23.89 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  25.67 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  28.06 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  27.15 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  26.8 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>