More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3516 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  68.56 
 
 
298 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  71.13 
 
 
302 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  33.89 
 
 
323 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  34.08 
 
 
319 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  33.21 
 
 
319 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
319 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  35.02 
 
 
319 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  36.7 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 
319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 
336 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
319 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
319 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  35.94 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 
339 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  33.59 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  35.48 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  35.02 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  33.19 
 
 
310 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
314 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 
312 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  31.1 
 
 
335 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  31.1 
 
 
335 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 
321 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 
321 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  34.53 
 
 
310 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  35.21 
 
 
319 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
320 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 
321 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  39.69 
 
 
315 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  31 
 
 
318 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.92 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  30.29 
 
 
637 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.55 
 
 
321 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  33.63 
 
 
313 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 
310 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 
264 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  29.76 
 
 
644 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  32.17 
 
 
327 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  31.6 
 
 
313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 
342 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 
342 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 
316 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  29.22 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  30.63 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
308 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
351 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.96 
 
 
318 aa  109  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  35.51 
 
 
315 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 
312 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 
311 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 
305 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 
318 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 
342 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 
318 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.72 
 
 
318 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
291 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 
321 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 
318 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 
310 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.8 
 
 
318 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  29.41 
 
 
314 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.19 
 
 
319 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  30.9 
 
 
349 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  30.13 
 
 
323 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  27.6 
 
 
309 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
315 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
322 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  31.25 
 
 
334 aa  102  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
346 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 
309 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  28.7 
 
 
318 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 
246 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  28.3 
 
 
316 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
249 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  29.58 
 
 
316 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.74 
 
 
329 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  28.3 
 
 
316 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  27.35 
 
 
317 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>