259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1240 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  61.86 
 
 		 313 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  45.33 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  45.24 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  42.19 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  42.95 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  35.14 
 
 		 644 aa  159  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  35.99 
 
 		 637 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  36.76 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  32.71 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  30.83 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 		 339 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  30.26 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.47 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.47 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.72 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  29.39 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  28.95 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.82 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  32.5 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 332 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.74 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  28.76 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 444 aa  86.7  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  26.87 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.8 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  26.1 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  27.15 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.7 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.67 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.47 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  29.53 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  31.86 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  32.72 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  26.11 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  28.51 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  31.08 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.34 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  26.24 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  28 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 591 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  25.47 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  24.67 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  33.48 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  25.84 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  31.08 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>