198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0686 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 597 aa  1137    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  45.67 
 
 		 309 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  45.58 
 
 		 313 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  45.73 
 
 		 307 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  45.73 
 
 		 307 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  45.37 
 
 		 317 aa  239  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  41.83 
 
 		 312 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  43.86 
 
 		 342 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  42.91 
 
 		 325 aa  226  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  40.56 
 
 		 298 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 		 315 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 		 315 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  37.46 
 
 		 342 aa  173  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  31.56 
 
 		 314 aa  125  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 		 323 aa  120  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 		 310 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  38.37 
 
 		 310 aa  108  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  38.37 
 
 		 310 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 315 aa  103  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 		 321 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  33.95 
 
 		 349 aa  98.6  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  30.22 
 
 		 323 aa  94.7  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  31.73 
 
 		 364 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  31.77 
 
 		 327 aa  92.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 351 aa  91.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 364 aa  90.5  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 318 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 346 aa  89.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 318 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 		 315 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  29.84 
 
 		 318 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.82 
 
 		 287 aa  88.2  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.1 
 
 		 333 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.8 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.04 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.05 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  31.69 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  27.23 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  25.68 
 
 		 337 aa  76.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  26.75 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 332 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 		 312 aa  73.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  30.65 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 		 343 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  26.99 
 
 		 644 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.81 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  30.31 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  23.38 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  22.11 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 321 aa  63.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 272 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.59 
 
 		 249 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.63 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  40.32 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 		 246 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.43 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  19.47 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  40.48 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 330 aa  57  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 486 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 		 308 aa  56.6  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 444 aa  57  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  31.19 
 
 		 292 aa  56.6  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 337 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  31.09 
 
 		 295 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 319 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.98 
 
 		 310 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 246 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 		 315 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 271 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.69 
 
 		 319 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  22.69 
 
 		 367 aa  55.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.99 
 
 		 319 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 318 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>