79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5991 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  29.28 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  28.15 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  24.18 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  23.93 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  23.5 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  24.79 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  24.79 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.65 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  23.24 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  24.62 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  24.6 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  30.25 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  24.34 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  24.61 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  24.07 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.57 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  22.71 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  24 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  22.63 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  22.73 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 		 293 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 293 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  32.32 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  24.79 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  23.28 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  21.83 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  22.63 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 		 342 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  25.59 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  21.89 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  21.05 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  23.57 
 
 		 315 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  22.61 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 310 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  23.11 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 		 352 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  23.7 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  21.67 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.61 
 
 		 299 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  22.27 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>