104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3173 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  99.75 
 
 
395 aa  809    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  99.49 
 
 
395 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  92.71 
 
 
444 aa  791    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  99.5 
 
 
404 aa  823    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  99.5 
 
 
404 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  98.51 
 
 
404 aa  817    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
486 aa  996    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  99.5 
 
 
404 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  73.06 
 
 
299 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  61.99 
 
 
295 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  61.99 
 
 
295 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  61.99 
 
 
295 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  64.07 
 
 
291 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  64.47 
 
 
293 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  58.69 
 
 
293 aa  364  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  60.47 
 
 
294 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  61.99 
 
 
295 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  62.36 
 
 
295 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  59.87 
 
 
293 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  60.07 
 
 
293 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  63.43 
 
 
291 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  52.55 
 
 
317 aa  328  9e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  53.11 
 
 
317 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  62.31 
 
 
296 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  55.87 
 
 
291 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  54.67 
 
 
291 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  52.25 
 
 
299 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  52.25 
 
 
299 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  52.5 
 
 
287 aa  309  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  51.56 
 
 
299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  54.41 
 
 
303 aa  303  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  56.88 
 
 
292 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  51.46 
 
 
307 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  51.46 
 
 
307 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  51.46 
 
 
307 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  51.46 
 
 
307 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  49.48 
 
 
299 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  49.64 
 
 
307 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  48.34 
 
 
298 aa  259  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  47.25 
 
 
283 aa  253  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  41.18 
 
 
292 aa  237  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  45.64 
 
 
293 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  43.43 
 
 
293 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  43.11 
 
 
289 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  37.71 
 
 
288 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.66 
 
 
299 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  34.07 
 
 
304 aa  200  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  37.46 
 
 
288 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 
266 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  33.21 
 
 
273 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  35.16 
 
 
292 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
273 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  30.82 
 
 
293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  32.93 
 
 
302 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0040  hypothetical protein  41.75 
 
 
134 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.14 
 
 
298 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 
337 aa  63.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  27 
 
 
342 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 
274 aa  60.1  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  22.92 
 
 
301 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  25.65 
 
 
299 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 
249 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 
299 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 
302 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 
278 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
597 aa  57.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  24.91 
 
 
526 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.34 
 
 
323 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.7 
 
 
318 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 
312 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
309 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  22.82 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 
332 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 
307 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  24.89 
 
 
319 aa  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  34.62 
 
 
364 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  23.65 
 
 
318 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.92 
 
 
318 aa  47.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 
313 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1455  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  47.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.95 
 
 
342 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  23.56 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 
246 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.41 
 
 
319 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  27.71 
 
 
239 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3833  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
344 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  24.57 
 
 
334 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  25.11 
 
 
287 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 
312 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  24.52 
 
 
314 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  23.46 
 
 
317 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
318 aa  44.3  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 
246 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  24.41 
 
 
312 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  25.4 
 
 
316 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>