285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1369 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 595 aa  1217    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  37.39 
 
 		 635 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  38.81 
 
 		 591 aa  350  4e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 		 652 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  32.64 
 
 		 662 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 654 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 		 657 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 		 653 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  31.88 
 
 		 653 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  32.79 
 
 		 653 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 		 656 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  32.79 
 
 		 660 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 		 657 aa  295  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  33.15 
 
 		 657 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 		 636 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 		 444 aa  289  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  30.04 
 
 		 673 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  31.74 
 
 		 658 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 661 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  29.69 
 
 		 667 aa  280  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.6 
 
 		 617 aa  278  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  33.05 
 
 		 1290 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  29.27 
 
 		 663 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 		 661 aa  276  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 		 655 aa  276  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  30.97 
 
 		 661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  31.15 
 
 		 661 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  31.06 
 
 		 660 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  31.15 
 
 		 661 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 		 661 aa  275  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  29.83 
 
 		 696 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.97 
 
 		 661 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 654 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.97 
 
 		 661 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 677 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  30.65 
 
 		 658 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 659 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  30.4 
 
 		 655 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 		 658 aa  268  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  30.47 
 
 		 658 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  28.82 
 
 		 653 aa  267  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 		 670 aa  267  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 611 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  30.33 
 
 		 655 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 631 aa  266  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 		 648 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  31.88 
 
 		 661 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  37.53 
 
 		 425 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 		 659 aa  262  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  29.36 
 
 		 648 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  30.43 
 
 		 626 aa  257  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 		 651 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 625 aa  257  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 		 641 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  31.22 
 
 		 645 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 		 669 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 651 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  31.21 
 
 		 625 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 625 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 		 628 aa  253  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 625 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  29.5 
 
 		 654 aa  249  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  30.04 
 
 		 653 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 675 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  29.14 
 
 		 621 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 629 aa  241  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  32.01 
 
 		 609 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 		 441 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  27.94 
 
 		 700 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 662 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 704 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 662 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 662 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.38 
 
 		 663 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 704 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 662 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 		 680 aa  216  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 		 701 aa  216  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  27.37 
 
 		 691 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 687 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 607 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  27.23 
 
 		 668 aa  210  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 673 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.52 
 
 		 666 aa  206  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 		 661 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 657 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 683 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 663 aa  193  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  27.1 
 
 		 357 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 417 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 441 aa  130  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  28.3 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 		 408 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 		 414 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  26.64 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  27.18 
 
 		 417 aa  97.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.95 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 299 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>