261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4534 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  100 
 
 		 319 aa  656    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  82.45 
 
 		 319 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  81.59 
 
 		 321 aa  551  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  77.74 
 
 		 318 aa  527  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  75.94 
 
 		 321 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  75.47 
 
 		 332 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  77.43 
 
 		 318 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  77.43 
 
 		 318 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  77.43 
 
 		 318 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  77.43 
 
 		 318 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  77.43 
 
 		 318 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  77.43 
 
 		 318 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  77.43 
 
 		 318 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  64.89 
 
 		 321 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  63.92 
 
 		 317 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  63.21 
 
 		 319 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  62.78 
 
 		 319 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  62.15 
 
 		 319 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  62.26 
 
 		 319 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  62.26 
 
 		 319 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  61.64 
 
 		 319 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  61.32 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  60.57 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  60.25 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  60.57 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  60.57 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  59.94 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  59.75 
 
 		 319 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  59.62 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  59.31 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  54.29 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  54.6 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  53.97 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  54.29 
 
 		 317 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  52.7 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  55.97 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  55.97 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  51.42 
 
 		 318 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  52.74 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  63.28 
 
 		 264 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  47.94 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  47.45 
 
 		 316 aa  322  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  47.62 
 
 		 316 aa  322  7e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  48.6 
 
 		 321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  49.38 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.2 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  48.74 
 
 		 319 aa  292  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  47.35 
 
 		 319 aa  292  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  44.69 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  33.09 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.73 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  30.08 
 
 		 353 aa  99.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.34 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.66 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.67 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.11 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.09 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  34.07 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  25.61 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  27.34 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.24 
 
 		 438 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  25.83 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1299  beta-lactamase-like protein  71.43 
 
 		 49 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.714571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  28.45 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  24.18 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  29.15 
 
 		 637 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  34.52 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  28.45 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  25.97 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  27.82 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 		 591 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  24.03 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.28 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>