185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4039 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 337 aa  700    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  53.25 
 
 		 316 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  38.24 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  30.82 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  32.78 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  27 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.48 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  30.91 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 319 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 305 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 318 aa  92.8  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.01 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  26.96 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  27.37 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  26.84 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 321 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25.19 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  26.1 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  25.67 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  24.48 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.07 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  26.18 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.47 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 597 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  27.27 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  23.15 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  24.31 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  24.2 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  25.63 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  23.4 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  22.52 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  23.51 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  24.38 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  23 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.76 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 595 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  21.24 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  22.76 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  24.24 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.42 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3473  beta-lactamase II  22.99 
 
 		 256 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00878467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3245  beta-lactamase II  23.27 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3500  beta-lactamase II  23.27 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  25.19 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  29.76 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  22.66 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  22.41 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  32.18 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  20.78 
 
 		 288 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2414  metallo-beta-lactamase family protein  20.78 
 
 		 288 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  23.84 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  24.81 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3452  beta-lactamase II  22.46 
 
 		 257 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  23.01 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  25.66 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3460  beta-lactamase II  22.91 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>