255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5378 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 293 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  82.94 
 
 		 293 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 246 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  26.05 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  25.22 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2969  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.37 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2362  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  27.44 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2433  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000453521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  21.9 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2235  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2399  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.295399  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.41 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2207  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2414  metallo-beta-lactamase family protein  25.26 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  25.26 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2155  Zn-dependent hydrolase  25.26 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  26.07 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  25.9 
 
 		 198 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.03 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.61 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.34 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.8 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  30.39 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  33.59 
 
 		 477 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 		 591 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  27.32 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  24.39 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.75 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  29.56 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  29.33 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  31.15 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.32 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  29.33 
 
 		 335 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  25.89 
 
 		 661 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.83 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  28.21 
 
 		 211 aa  52.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 		 313 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  22.65 
 
 		 701 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.38 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  23.5 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  24.35 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  25.51 
 
 		 637 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  26.42 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  27.01 
 
 		 660 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  25.59 
 
 		 658 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  32.03 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  25.59 
 
 		 658 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  22.22 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  23.93 
 
 		 198 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>