More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1288 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 329 aa  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  28.86 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  30.53 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  31.7 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  29.05 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  27.3 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  30.51 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.36 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 317 aa  96.3  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 		 242 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  30.39 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.57 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  26.94 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.31 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.94 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.94 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  26.57 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  36.22 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.4 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  35.39 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  35.39 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.29 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 		 209 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 		 228 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  26.42 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  28.21 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  30.22 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  29.77 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  34.24 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  26.89 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  26.89 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  26.89 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 240 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.13 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.39 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  35.03 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  29.18 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  26.89 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  31.31 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  33.66 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 		 212 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  35.34 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 221 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  28.45 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>