179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1871 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 309 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  41.99 
 
 		 312 aa  241  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  37.54 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  41.4 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  35.56 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  30.04 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  29.64 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  34.42 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  29.81 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  27.3 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 		 342 aa  105  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  27.02 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  25.87 
 
 		 367 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.85 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.95 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.97 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  25.71 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  26.95 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  23.43 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.67 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  25.23 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.93 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.6 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  26.48 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.6 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  25.08 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  22.44 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.09 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  24.84 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.19 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  24.77 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25.19 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.22 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  24.33 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  24.31 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  23.32 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  25.17 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  24.74 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  26.58 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  26.58 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  22.95 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  20.45 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.05 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  23.55 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  25.61 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  24.57 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  23.76 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  33.9 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  22.85 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  32.76 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>