171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0472 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  100 
 
 
298 aa  608  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  66.55 
 
 
342 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  52.33 
 
 
334 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  53.66 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  53.66 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  49.66 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  47.1 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  47.44 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  47.44 
 
 
307 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 
309 aa  258  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  46.85 
 
 
342 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  43.05 
 
 
325 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 
317 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  40.56 
 
 
597 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 
315 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  30.14 
 
 
314 aa  122  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  31.62 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 
310 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 
322 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  32.01 
 
 
327 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 
310 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 
310 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
347 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.58 
 
 
323 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
320 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 
349 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  28.28 
 
 
364 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
364 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
352 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  33.69 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.32 
 
 
333 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.14 
 
 
318 aa  99  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 
346 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.43 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  32.79 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  32 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 
337 aa  93.6  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 
321 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  31.99 
 
 
351 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
343 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  23.53 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  26.69 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  23.62 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  27.91 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  21.74 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.47 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  26.19 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
342 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.68 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
314 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  24.12 
 
 
319 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  28.77 
 
 
319 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.21 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  32.85 
 
 
644 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 
319 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.75 
 
 
319 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  23.74 
 
 
316 aa  58.9  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.46 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>