254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1197 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 317 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  64.76 
 
 		 318 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  63.92 
 
 		 319 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  63.41 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  63.81 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  63.81 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  80.71 
 
 		 264 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  60.88 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  63.81 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  63.81 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  63.81 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  63.81 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  63.81 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  60.82 
 
 		 319 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  60.82 
 
 		 321 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  60.82 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  60.38 
 
 		 319 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  61.13 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  61.13 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  60.06 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  58.93 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  59.43 
 
 		 319 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  59.87 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  60.19 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  59.43 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  59.75 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  59.75 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  59.75 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  59.43 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  59.12 
 
 		 339 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  58.68 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  56.47 
 
 		 316 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  56.78 
 
 		 317 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  57.99 
 
 		 335 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  57.99 
 
 		 335 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  55.21 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  55.84 
 
 		 317 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  55.52 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  53.8 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  56.23 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  54.11 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  53.94 
 
 		 316 aa  363  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  53.94 
 
 		 316 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  51.27 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.06 
 
 		 319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  48.59 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  46.71 
 
 		 319 aa  292  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  47.98 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  44.51 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.56 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  34.33 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  35.38 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  29.73 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1299  beta-lactamase-like protein  89.8 
 
 		 49 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.714571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  30.66 
 
 		 637 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 272 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  28.35 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.04 
 
 		 333 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.68 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  32.42 
 
 		 310 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.75 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  29.83 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1030  metallo-beta-lactamase family protein  26.52 
 
 		 282 aa  89.4  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00771484  hitchhiker  0.000295307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  24.72 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  30.83 
 
 		 644 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  28.37 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.41 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  24.49 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  23.44 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  25.87 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  23.55 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>