183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0813 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
322 aa  633  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  63.75 
 
 
320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  61.95 
 
 
319 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  63.12 
 
 
320 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  60.25 
 
 
319 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  60.57 
 
 
319 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  46.23 
 
 
317 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  46.06 
 
 
318 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  44.69 
 
 
318 aa  281  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  46.37 
 
 
316 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  46.06 
 
 
316 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  45.43 
 
 
317 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  48.46 
 
 
321 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  47.63 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  47.63 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  47.63 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  47.63 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  47.63 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  47.63 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  47.63 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  46.2 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  46.69 
 
 
318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  45.74 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  46.71 
 
 
321 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  45 
 
 
319 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  43.85 
 
 
316 aa  265  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  43.35 
 
 
316 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  44.51 
 
 
319 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  44.41 
 
 
321 aa  262  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  45 
 
 
319 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  45 
 
 
319 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  45.82 
 
 
332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  44.06 
 
 
319 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  44.51 
 
 
317 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  43.75 
 
 
319 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 
319 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  44.69 
 
 
319 aa  255  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  44.69 
 
 
319 aa  255  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  43.26 
 
 
319 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  43.26 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  43.2 
 
 
329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  43.57 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  43.57 
 
 
336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  43.57 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  43.26 
 
 
339 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  43.57 
 
 
319 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  43.4 
 
 
319 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  44.24 
 
 
335 aa  242  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  44.24 
 
 
335 aa  242  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  51.02 
 
 
264 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.72 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  32.99 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.4 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  23.05 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.2 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  23.44 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.89 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  27.36 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  27.07 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.47 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3245  beta-lactamase II  30.05 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3500  beta-lactamase II  30.05 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3473  beta-lactamase II  27.32 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00878467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3460  beta-lactamase II  29.51 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  24.72 
 
 
353 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  25.69 
 
 
325 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2433  metallo-beta-lactamase family protein  21.43 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000453521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
313 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3452  beta-lactamase II  28.42 
 
 
257 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.88 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3218  beta-lactamase II  28.96 
 
 
256 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  22.48 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2969  metallo-beta-lactamase family protein  22.48 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  27.18 
 
 
257 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2362  metallo-beta-lactamase family protein  22.43 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1299  beta-lactamase-like protein  46.94 
 
 
49 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.714571  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  26.04 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  21.34 
 
 
362 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 
318 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 
408 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3447  beta-lactamase II  26.34 
 
 
257 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1030  metallo-beta-lactamase family protein  25.76 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00771484  hitchhiker  0.000295307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>