196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1269 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
331 aa  675    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 
304 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  27.76 
 
 
362 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
315 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
249 aa  92.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.09 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.22 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  28.79 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  28.79 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.83 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  28.89 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.34 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  25.74 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  27.64 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  27.64 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.91 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  24.9 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  32.27 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.97 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.21 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.1 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  26.87 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  28.46 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.05 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  23.21 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.79 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  25 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  27.6 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  25.2 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.02 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  26.74 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  23.41 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  26 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  24.73 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.75 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  25.82 
 
 
644 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  23.63 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  23.95 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  26.46 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  24.73 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 
319 aa  62.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  21.01 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  27 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  24.62 
 
 
288 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>