236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0906 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 316 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  97.47 
 
 		 316 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  95.57 
 
 		 317 aa  630  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  90.51 
 
 		 317 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  89.87 
 
 		 318 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  84.13 
 
 		 318 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  62.54 
 
 		 316 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  62.34 
 
 		 316 aa  407  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  61.39 
 
 		 316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  58.62 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  60.06 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  58.81 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  58.62 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  59.18 
 
 		 321 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  58.62 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  57.55 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  58.62 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  57.86 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  57.23 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  57.96 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  58.31 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  57.23 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  57.23 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  57.23 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  57.99 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  57.23 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  56.47 
 
 		 317 aa  381  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  54.29 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  55.7 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  56.74 
 
 		 335 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  56.74 
 
 		 335 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  57.01 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  57.01 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  57.01 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  57.01 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  57.01 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  57.01 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  57.01 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  54.72 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  55.93 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  53.46 
 
 		 332 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  53.97 
 
 		 321 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  51.89 
 
 		 320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  52.35 
 
 		 319 aa  325  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.9 
 
 		 319 aa  316  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  48.43 
 
 		 319 aa  315  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  47.77 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  49.69 
 
 		 320 aa  305  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  53.54 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  46.37 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.51 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.75 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  27.82 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  30.23 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  27.56 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.91 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  23.95 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  24.18 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.62 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  23.9 
 
 		 438 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  28.73 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  25.69 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  23.53 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1299  beta-lactamase-like protein  63.27 
 
 		 49 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.714571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  24.81 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  24.61 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  23.93 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.1 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  23.74 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  26.64 
 
 		 637 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  24.76 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>