223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1904 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 300 aa  618  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  86.67 
 
 		 300 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  34.68 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  36.88 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 479 aa  99.4  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.05 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.8 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.25 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  33.67 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.95 
 
 		 438 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.41 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  25.29 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  25.29 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.21 
 
 		 319 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 		 319 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  26.12 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  26.81 
 
 		 318 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.95 
 
 		 319 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 		 319 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.95 
 
 		 319 aa  89  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.68 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  25.09 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  26.62 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.26 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  25.69 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  25.69 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  24.61 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  25.9 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.97 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.45 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  23.44 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  23.15 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  22.78 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  27.06 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  23.94 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1117  beta-lactamase domain-containing protein  27.02 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  26.64 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  24.06 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  23.4 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  23.99 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  21.89 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  29.03 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  22.62 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  34.64 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  23.63 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  20.91 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  23.82 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  23.63 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3485  Beta-lactamase  29.17 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  22.64 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0410  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  23.44 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.85 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>