220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2195 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 289 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  67.18 
 
 		 294 aa  384  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  58.04 
 
 		 292 aa  364  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  61.05 
 
 		 291 aa  362  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  60.75 
 
 		 287 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  58.87 
 
 		 288 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  47.08 
 
 		 292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  48.75 
 
 		 296 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  40 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  42.64 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  37.85 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  37.07 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  31.27 
 
 		 318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  31.71 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  32.28 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  32.28 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  31.95 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  31.99 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.88 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  26.56 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.5 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.65 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  25.11 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  22.3 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.2 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  25.33 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  26.67 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  26.44 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.28 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.32 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  24.86 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  22.53 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  22.53 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  22.49 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  25.7 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  26.01 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  22.09 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  24.32 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  22.58 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  25.51 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  24.28 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  24.56 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  21.48 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  21.19 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  23.68 
 
 		 353 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  30.57 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  23.66 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  22.57 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  22.63 
 
 		 644 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  22.98 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  24.22 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  22.08 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  24.22 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.08 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.2 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  21.18 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>